《表4 显著差异表达基因及各个通路富集分析》
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《转录组测序筛选野生大豆糖代谢途径干旱相关基因及其表达差异分析》
注:Ⅰ:处理0 h样本;Ⅱ:处理6 h样本;Ⅲ:处理12 h样本;Ⅳ:处理24 h样本;Ⅴ:处理48 h样本
通过显著差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)的上调表达及下调表达情况可以了解样本间的差异概况。对获取的基因簇信息进行差异表达基因筛选,这些差异表达基因在不同处理时间点的两两对比下的情况如表4所示。以未处理材料作为参照,在处理12 h前的上/下调基因随处理的时间增长而增多;在处理12 h时最多,之后随处理的时间增长而减少;而处理24 h和48 h时的材料比处理12 h时的材料中差异表达下调基因数目都多;进一步说明部分基因在处理12 h时基因瞬时上调表达,在之后又恢复或低于原始表达量;差异表达倍数在5倍以上的基因在处理各个时间点均有分布,在处理12 h前随处理时间增长而增多;处理24 h样本与处理48 h样本的两两比较下,仅有1个基因差异倍数在5倍以上;由功能分析也可以看出,在处理12 h的GO功能注释的基因种类最丰富;KEGG注释的基因种类也最丰富。
图表编号 | XD00159971300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.08.01 |
作者 | 张小芳、乔潇、俎天娇、张锴、韩金玲、乔亚科、李桂兰 |
绘制单位 | 河北科技师范学院农学与生物科技学院、河北科技师范学院物理系、河北科技师范学院农学与生物科技学院、河北科技师范学院农学与生物科技学院、河北科技师范学院农学与生物科技学院、河北科技师范学院农学与生物科技学院、河北科技师范学院农学与生物科技学院 |
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