《表1 转录组测序数据产出情况汇总表》
使用BGISEQ-500平台一共测了15个鸭十二指肠黏膜组织样品,Total raw reads数分别为108 M、107.43 M、107.76 M。进行质控(QC)后得到的Total clean reads数分别为Clean reads 107.11 M条、106.59 M条、106.83 M。将样品组织Total clean reads与NCBI中Anas platyrhynchos(北京鸭)参考基因组比对,发现T24与T48 Clean reads Q30(%)高达89.13%,满足Q30标准;不确定碱基(N)比例均小于0.068%;CK、T24、T48三个组的GC值为49.468%、48.936%、49.588%;比对参考基因组唯一位置,映射率均达到74.3%以上,从测序结果分析可以看出数据质量较高,可以用于后期分析(表1)。
图表编号 | XD00156642100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.05.25 |
作者 | 张旭、吴征卓、姚碧琼、施大军、周碧君、文明、程振涛、王开功、陈国权、田琴、阎朝华 |
绘制单位 | 贵州大学动物科学学院、贵州省动物疫病研究室、贵州大学动物科学学院、三穗县鸭产业化建设管理办公室、三穗县鸭产业化建设管理办公室、贵州千里山生态食品股份有限公司、贵州大学动物科学学院、贵州省动物疫病研究室、贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室、贵州大学动物科学学院、贵州省动物疫病研究室、贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室、贵州大学动物科学学院、贵州省动物疫病研究室、贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室、贵州大学动物科学学院、贵州省动物疫病研究室、贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室、贵州大学动物科学 |
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