《表1 转录组测序数据基本情况Tab.1 Details of transcriptome raw data》

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《转录组分析组蛋白去乙酰化酶抑制剂TSA对毛白杨悬浮细胞表达谱的影响》

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注Notes:Raw reads，原始序列数据；Clean reads，过滤后数据；Clean reads percentage，过滤后数据百分比；Clean bases，转化数据；Error rate，误码率；Q20（Q30），Phred数值大于20、30的碱基百分比；GC content，G和C数量占总碱基百分比；FPKM Interval，expected number of fragm

转录组样本原始测序数据具体见表1，整体评估优良，结果合格可用。所有有效序列百分数均大于97%，平均GC含量为44.24%，总数据大小为19.76 Gb。采用表达差异倍数（Fold change，x）以及精确检验统计学方法，对经过0.5μmol/L TSA处理10 d和对照组的毛白杨悬浮细胞表达基因进行差异表达基因筛选（log2x>2，P<0.05）。如图2所示，共有4 465个基因的转录水平存在显著性差异（DEGs），上调基因数量为2 363个，下调基因数量为2 102个。