《表2 南酸枣转录组拼接结果数据统计》

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《基于高通量测序的南酸枣转录组分析》


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Clean reads经Trinity软件从头组装拼接后,获得长度区间在201~15 659 bp的89 244条转录本序列,总长度为72 404 353 bp,平均长度为811 bp,N50为1 547 bp。在此基础上,进一步组装得到46936条Unigene,总长度为60402676bp,平均长度为1287bp,N50为1 841 bp,其中,长度区间在200~500 bp占23.07%,在500~1000bp占28.62%,在1000~2000bp占28.96%,在2000bp以上的占19.35%(表2),序列经拼接组装后获得的Unigene片段较长,说明组装质量较好。