《表2 转录组拼接结果Tab.2 Assembly statistic of transcripts and unigenes》

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《基于转录组分析筛选凡纳滨对虾低温胁迫下的差异表达基因》


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注:N50和N90分别为将拼接转录本按长度从长至短排序,累加转录本的长度,到不小于总长50%和90%的拼接转录本的长度.Note:N50 and N90 are the lengths of the spliced transcripts from long to short,and the length of the transcripts is increased to not less than the le

本研究对Illumina Hiseq 2500测序得到的原始数据进行拼接,结果如表2所示。拼接后共得到61098条转录本(Transcripts),其拼接长度范围在200~37499 bp,平均长度为1000 bp,N50为2043 bp,长度大于2000 bp的有8569条,约占全部Transcript的14%。同时得到50921条基因(unigenes),其拼接长度范围在200~37499 bp,平均长度为828 bp,N50为1589 bp,其中长度大于2000 bp的有5130条,约占总基因(unigene)的10%。拼接结果说明原始数据拼接质量较高,可用于后续功能注释和差异表达基因分析。