《表1 火龙果转录组Transcript和Unigene长度分布统计》
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《红肉火龙果(Hylocereus polyrhizus)果实与茎转录组测序分析》
使用Trinity软件对所有Clean read进行De novo拼接。共计获得111 641个Transcript(转录本),碱基数量为99 861 193 bp(99.86 Mb)。转录本平均长度为894 bp,N50长度为1 618 bp。其中长度为200~300 bp,301~500 bp,501~1 000 bp,1 001~2 000 bp和≥2 001 bp的Transcript百分比分别为30.34%,21.80%,18.76%,17.28%和11.81%(表1)。所有转录本序列进一步组装得到79 658个Unigene(单基因簇),碱基数量为54 975 059 bp(54.98 Mb)。Unigene平均长度为690bp,N50长度为1216bp。其中长度为200~300 bp,301~500 bp,501~1 000 bp,1 001~2 000 bp和≥2 001 bp的Unigene百分比分别为39.21%,25.42%,16.70%,11.38%和7.28%(表1)。
图表编号 | XD0031210200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.01.14 |
作者 | 郑乾明、王壮、蔡永强、马玉华 |
绘制单位 | 贵州省农业科学院果树科学研究所、贵州省农业科学院果树科学研究所、贵州省农业科学院果树科学研究所、贵州省农业科学院果树科学研究所 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |