《表1 拼接转录本和基因序列长度频数分布》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《牡丹(Paeonia suffruticosa Andr.)根组织差异表达基因分析》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

通过Illumina HiSeqTM4000高通量测序平台对试验区6年生凤丹（Paeonia ostii'Phoenix White'）和冰山雪莲（Paeonia rockii'Bing Shan Xue Lian'）2个品种幼根组织进行转录组测序，得到原始序列数据raw reads，然后对raw reads进行过滤，去掉带有接头、低质量和无法确定碱基信息的reads，得到测序序列数据Clean reads，其中表征数据质量的Q20和Q30大于90%，GC含量在45%左右，数据质量达到后续分析要求；同时采用Trinity软件对不同长度的转录本clean reads进行拼接处理，得到转录本拼接文件Trinity fasta，从同一个基因的不同转录本中挑选出最长的转录本作为该基因的Unigene，最后得到276043条Unigene，以此进行后续注释分析。转录本和Unigene长度分布频数显示（表1），转录本和Unigenes的长度主要分布在200～1 000 bp之间，转录本transcript平均长度583 bp，Unigene平均长度837 bp，反映拼接效果的N50长度分别为798 bp和1 064 bp，大于其平均长度，表明拼接片段的完整性较好。