《表3 茉莉花转录组中转录本和单基因簇的序列大小》
根据测序产生的原始序列文件,过滤掉低质量的序列后进行统计分析。通过Trinity初步从头组装,获得2 883 742个转录本,总长度达到1 328 373 387 bp,最长序列为30 951 bp,最短序列为201 bp,平均长460.64 bp,N50长489 bp;进一步组装得到2 452 457个单基因簇Unigene,总长度为1 011 078 933 bp,最长序列为30 951 bp,最短序列为201 bp,平均长412.27 bp,N50长425 bp。对组装获得的转录本和单基因簇长度分布进行分析,结果如表3所示,所占比例最大的是100–400 bp,分别占66.026%(1 904 022条)和68.164%(1 671 695条),其次为401–1 000 bp,分别占27.268%(786 349条)和27.868%(683 448条)。长度大于4 000 bp的分别占0.168%(4 858条)和0.058%(1 425条)。
图表编号 | XD00225185700 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2020.09.25 |
作者 | 陈笛、郭永春、陈雪津、王鹏杰、陈桂信、叶乃兴 |
绘制单位 | 福建农林大学园艺学院茶学福建省高校重点实验室、福建农林大学园艺学院茶学福建省高校重点实验室、福建农林大学园艺学院茶学福建省高校重点实验室、福建农林大学园艺学院茶学福建省高校重点实验室、福建农林大学园艺学院茶学福建省高校重点实验室、福建农林大学园艺学院茶学福建省高校重点实验室 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |