《表4 南亚实蝇转录组中与嗅觉相关基因统计》

《表4 南亚实蝇转录组中与嗅觉相关基因统计》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《南亚实蝇转录组及嗅觉相关基因的初步分析》


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通过对7大公共数据库同源比对和注释分析,528个嗅觉相关基因在南亚实蝇转录组中获得鉴定。其中包括34个OBPs、3个化学感受蛋白基因[Chemosensory protein(CSP)genes]、20个嗅觉受体基因[Olfactory receptor(Or)genes]、43个离子型受体基因[Ionotropic receptor(IR)genes]、204个昆虫触角G蛋白基因(GTP binding protein genes)、5个昆虫感觉神经元膜蛋白[Sensory neuron membrane proteins(SNMPs)]基因和219个气味降解酶基因[Odor degrading enzymes(ODE)genes](表4)。对OBPs的分析发现,28条具有完整的开放阅读框,进一步氨基酸序列分析表明,2条属于Minus-OBPs,1条为Dimer-OBPs,1条为“Plus-C”OBP,24条为典型OBPs;对30条结构较完整的南亚实蝇OBPs序列与黑腹果蝇D.melanogaster(58条)、瓜实蝇B.cucuribitae (34条)、地中海实蝇C.capitata (28条)、橘小实蝇B.dorsalis (47条)OBPs序列进行进化分析表明(图4),B.tau OBP多数至少与一种实蝇OBP同源物聚类在一支,且拥有80%以上的序列一致性,仅有极个别B.tau OBP与同一支上的实蝇OBP序列一致性较低,如C29372.graph_c0与Bdor OBP (AKM45842.1)序列一致性仅为44%且在进化树中形成一个独立的小分支,表明不同种类的实蝇OBPs出现了各自的分化。