《表3 菌株QYY转录组中部分与喹啉降解过程有关的差异表达基因》

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《睾丸酮丛毛单胞菌QYY降解喹啉的转录组分析》

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KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes）数据库整合了基因组、化学和系统功能信息，是一个综合数据库．C/Q-100和C/Q-400组中的1 116和1 600个差异表达基因分别匹配到104和110个KEGG途径中，其中匹配到代谢（metabolism）途径中的通路数量最多，分别有81和87个通路；在菌株QYY降解喹啉的生物过程中，ABC转运蛋白作为膜转运（membrane transport）中的重要部分，差异表达基因富集到其上的数目分别为61和79个．对C/Q-100和C/Q-400两组差异表达基因中关于代谢途径部分的上调表达的基因进行二级分类富集，结果见图3．编码与喹啉降解过程相关酶和ABC转运蛋白的部分差异表达基因信息见表3．其中碳水化合物代谢（carbohydrate metabolism）和氨基酸代谢（amino acid metabolism）过程均能产生能量，这些过程与能量代谢（energy metabolism）过程一同为菌株QYY降解喹啉、维持生长提供能量，转录组数据显示相关基因显著上调表达．在异生物素的生物降解与代谢（xenobiotics biodegradation and metabolism）的转录组数据中，发现与喹啉降解过程中相关的ligABC和bphB基因的差异表达．