《表3 CK组或C组中转录本相对丰度最高的差异ASV所在部分属分离菌株的反硝化通路》

《表3 CK组或C组中转录本相对丰度最高的差异ASV所在部分属分离菌株的反硝化通路》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《硫化物抑制潮土反硝化过程中氧化亚氮还原的菌群机制》


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注:Bacillus分离的菌株太多,具体菌株名称不展示.+:反硝化的某个步骤在分离的菌株中存在.

使用LEf Se挑选CK、C、S和C+S组中的差异ASV (LDA=2.0),共挑选获得41个差异ASV (图5)。通过计算差异ASV与N2O指数的Spearman相关矩阵,发现17个差异ASV与N2O指数有显著关系,这17个差异ASV中2个在CK组中转录本相对丰度最高,9个在C组中转录本相对丰度最高,5个在S组中转录本相对丰度最高,1个在C+S组中转录本相对丰度最高(表2)。在CK组和C组中转录本相对丰度最高的差异ASV与N2O指数显著负相关,在S组和C+S组中转录本相对丰度最高的差异ASV与N2O指数显著正相关(表2)。在CK组和C组中转录本相对丰度最高的差异ASV分布于厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)和疣微菌门(Verrucomicrobia),而在S组和C+S组中转录本相对丰度最高的差异ASV分布于蓝藻门(Cyanobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)和肠杆菌门(Entotheonellaeota)(表2)。17个ASV并不都能注释到属水平,其中在CK组和C组中转录本相对丰度最高的属包括固氮弧菌属(Azoarcus)、微枝形杆菌属(Microvirga)、剑菌属(Ensifer)、氮氢单胞菌(Azohydromonas)、芽孢杆菌属(Bacillus)、斯科曼氏球菌属(Skermanella)、申氏杆菌属(Shinella)和西索恩氏菌(Chthoniobacter),而在S组和C+S组中转录本相对丰度最高的属包括Gaiella属和席藻属(Phormidium)(表2,图6)。使用KEGG数据库查询以上属的反硝化代谢通路,只有固氮弧菌属(Azoarcus)、微枝形杆菌属(Microvirga)、剑菌属(Ensifer)、芽孢杆菌属(Bacillus)和申氏杆菌属(Shinella)的反硝化代谢通路可以被检索到(表3)。从表3还可以看出:固氮弧菌属(Azoarcus)和申氏杆菌属(Shinella)的分离菌株是具备产生N2O能力的N2O还原菌;芽孢杆菌属(Bacillus)的分离菌株是同时不具备N2O产生和还原能力的反硝化细菌;微枝形杆菌属(Microvirga)中部分分离菌株(Microvirga sp.17 mud 1-3和Microvirga sp.HR1)是具备产生N2O能力的N2O还原菌,部分分离菌株(Microvirga ossetica)是同时不具备N2O产生和还原能力的反硝化细菌;剑菌属(Ensifer)部分分离菌株(Ensifer adhaerens Casida A)是具备产生N2O能力的N2O还原菌,部分分离菌株(Ensifer adhaerens OV14和Ensifer alkalisoli)是不具备产生N2O能力的N2O还原菌。