《表3 淹水胁迫后差异表达基因最多的转录因子家族》
以log2Fold Change表示差异倍数,在淹水胁迫后筛选出636条差异表达转录因子序列,属于61个转录因子家族。在淹水敏感无性系中,淹水胁迫后上调表达基因数量4 488个,其中转录因子基因217个,下调表达的基因5 901个,转录因子基因191个。在耐淹无性系中,淹水胁迫后上调表达基因数量2 015个,转录因子基因103个,下调表达的基因数量1 793个,转录因子基因91个。淹水胁迫后,耐淹无性系相对敏感无性系差异基因639个,上调表达基因325个,包含21个转录因子序列,314个下调表达基因包含13个转录因子基因。其中,MYB、Zinc finger、NAC、Orphans、WRKY、Homebox domain、AP2 domain、b H-LH、AUX/IAA family等转录因子家族在北美鹅掌楸淹水后差异表达基因数量最多(表3)。但不同北美鹅掌楸无性系淹水胁迫后转录因子的表达调控存在一定差异。淹水胁迫后,MYB、NAC、WRKY、AP2 domain等转录因子家族成员在耐淹和淹水敏感的北美鹅掌楸无性系中上调表达比下调表达的序列多;Orphans、AUX/IAA、Zinc finger CCH domain等转录因子家族成员在耐淹和淹水敏感无性系中普遍下调表达。
图表编号 | XD00194384200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.12.28 |
作者 | 谭胤静、孙小艳、伍祎翌、李晓晖、辛在军 |
绘制单位 | 江西省科学院生物资源研究所、江西省科学院生物资源研究所、江西省科学院流域生态研究所江西省重金属污染生态修复工程技术研究中心、江西省科学院流域生态研究所江西省重金属污染生态修复工程技术研究中心、江西省科学院流域生态研究所江西省重金属污染生态修复工程技术研究中心、江西省科学院流域生态研究所江西省重金属污染生态修复工程技术研究中心 |
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