《表4 转录因子相关差异表达基因的信息分析》

《表4 转录因子相关差异表达基因的信息分析》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《烯效唑对低温胁迫下薏苡幼苗光合特性及相关转录因子基因表达的影响》


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Log2FC:对两样品间表达量的比值取对数;CK_VS_CKL:对照组与低温胁迫组比较;CKL_VS_S3307:低温胁迫组与S3307处理组比较

在低温胁迫诱导的差异表达基因中,数量最多的转录因子家族是WRKY、AP2/ERF、bHLH和bZIP,其表达模式各不相同(表4)。低温胁迫后,共有53个转录因子呈现上调表达,137个转录因子呈现下调表达;其中,与低温胁迫相关的转录因子WRKY家族(4个基因)、bZIP家族(6个基因)、bHLH家族(9个基因)、AP2-ERF家族(6个基因)都为下调表达(P<0.01)。在S3307预处理后的低温胁迫诱导下,共有120个转录因子呈现上调表达,70个转录因子呈现下调表达;上述4个转录因子家族的差异表达基因变化模式各不相同,在低温处理组下调的转录因子家族(WRKY,bZIP,bHLH,AP2-ERF)差异表达基因中,大部分在S3307处理组呈现上调表达(P<0.05)。在Swiss-Prot数据库中,所筛选出来大部分差异表达的转录因子与拟南芥(Arabidopsis thaliana)相关转录因子家族基因同源性较高,在数据库中注释比例最高;另外5个差异基因注释为水稻(Oryza sativa),3个差异基因注释为玉米(表4)。qRT-PCR结果表明,随机选取的10个差异表达基因在低温胁迫及S3307处理组的表达水平呈现与RNA-seq转录组结果基本一致的趋势(图4)。