《表2 转录本和单基因簇的长度统计》
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《基于天竺桂转录组测序的SSR序列分析及EST-SSR标记开发》
利用Illumina Hi SeqTM高通量测序平台对南京中山植物园苗圃地中3株一年生天竺桂幼苗上采取嫩叶和根转录组进行测序,结果共得到14.43 Gb Clean data,各样品Clean data均达到6.99 Gb,Q30碱基百分比在93.06%及以上(表1),Raw data均已上传至NCBI数据库,登录号为:SRR8475572。组装共得到80 149条Unigene,Unigene的N50为1 236,组装完整性较高。其中长度在1 kb以上的Unigene有17 328条,平均长度为751.47 bp (表2)。将根和叶片两个样品的Clean data与组装得到的Unigene库进行序列比对,两个样本的Mapped ratio分别为77.27%和80.27%。
图表编号 | XD00189118000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.11.14 |
作者 | 段豪、施钦、王紫阳、宣磊、徐建华、杨颖、芦治国 |
绘制单位 | 中国科学院植物研究所江苏省落羽杉属树木种质创新与繁育工程研究中心、中国科学院植物研究所江苏省落羽杉属树木种质创新与繁育工程研究中心、中国科学院植物研究所江苏省落羽杉属树木种质创新与繁育工程研究中心、中国科学院植物研究所江苏省落羽杉属树木种质创新与繁育工程研究中心、中国科学院植物研究所江苏省落羽杉属树木种质创新与繁育工程研究中心、中国科学院植物研究所江苏省落羽杉属树木种质创新与繁育工程研究中心、中国科学院植物研究所江苏省落羽杉属树木种质创新与繁育工程研究中心 |
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