《表2 转录本和单基因簇的长度统计》

《表2 转录本和单基因簇的长度统计》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《基于天竺桂转录组测序的SSR序列分析及EST-SSR标记开发》


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利用Illumina Hi SeqTM高通量测序平台对南京中山植物园苗圃地中3株一年生天竺桂幼苗上采取嫩叶和根转录组进行测序,结果共得到14.43 Gb Clean data,各样品Clean data均达到6.99 Gb,Q30碱基百分比在93.06%及以上(表1),Raw data均已上传至NCBI数据库,登录号为:SRR8475572。组装共得到80 149条Unigene,Unigene的N50为1 236,组装完整性较高。其中长度在1 kb以上的Unigene有17 328条,平均长度为751.47 bp (表2)。将根和叶片两个样品的Clean data与组装得到的Unigene库进行序列比对,两个样本的Mapped ratio分别为77.27%和80.27%。