《表2 蒙古栎叶片转录组的Transcript和Uni Gene长度分布统计》

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《蒙古栎叶片的转录组测序及基因功能注释》

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对蒙古栎叶片进行转录组测序后，共获得7.94GB数据，包含52 934 562条原始reads，过滤掉低质量的reads后，得到7.63 GB数据以及52 076 914条有效reads，Q20和Q30碱基百分比分别达到98.06%、95.04%。所有原始reads上传至Gene Expression Omnibus （GEO）数据库（登录号:GSE125799）。所有有效reads经Trinity组装平台拼接组装共得到39 130个Transcript，总长度为39 944 345 bp，平均长度为742 bp，GC含量为42.12%，N50长度为1 535 bp，表明组装完整性较高（表1）。所有样本最后进行归一化得到24 196个Uni Gene，总长度为24 680 920 bp，N50长度为1 553bp，平均长度为732 bp，GC含量为42.34%（表1）。Transcript和Uni Gene长度主要分布在1 000～2 000bp，共有34 442和24 196个，分别占总量的88.03%和87.88%（表2）。