《表1 大刍草转录组Transcript和Unigene数据组装结果》

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《玉米野生近缘种大刍草幼苗叶片的转录组SSR分析》


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转录组测序共获得transcript序列315 911条,其总长度为267 875 751 bp,平均长度为847.95 bp,N50为1 267 bp,N90为368 bp。原始序列经组装拼接以后获得了105 927条Unigenes。这些Unigenes的总长度为77 245 255 bp,平均长度为729.23 bp,N50为1 112 bp,N90为299 bp(表1)。Unigenes序列长度均大于等于200 bp,其中,处于200~400 bp范围的有47 403条,占总数的44.751%;400~600 bp的序列有18 033条,600~800 bp的序列有10 426条,800~1 000 bp的序列有7 023条,占总数的6.630%(图2)。