《表2 口虾蛄转录组数据组装结果统计表》

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《口虾蛄青岛和舟山群体比较转录组研究》

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注：N50表示将拼接转录本从小到大排列，计算各转录本的长度和，直至超过总长的50%的转录本长度.

利用高通量测序平台（IlluminaHiSeqTM2000）对2个群体的口虾蛄样品（各3个个体）进行转录组测序后得到的Raw reads及去除杂质之后的Clean reads结果（表1）。共获得266 531 026条clean data，质量参数Q20最低为97.50%（舟山），最高为98.15%（青岛）；6个个体的GC含量在46.80%～49.11%之间。利用Trinity软件对获得的2个群体的clean reads分别进行组装，青岛获得121 606条Unigene，平均长度为991 nt，N50为1 914 nt；舟山获得157 584条Unigene，平均长度为734 nt，N50为1 372 nt。对2个群体进行总的Unigene组装，共获得60 223条Unigene，平均长度为897 nt，N50为1 422 nt（表2）。