《表3 泡桐根部基因和转录本长度分布》

《表3 泡桐根部基因和转录本长度分布》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《泡桐根系应答铅锌矿胁迫的转录组分析》


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提取泡桐根部RNA后由Nova-seq高通量测序,共获得366 701 960条reads序列,总碱基数为53.90 Gb,平均GC含量达44.58%。序列质量评估值Q20、Q30均达90%以上(表2),说明通过测序所得到原始序列数据较好,可用于后续的序列组装。用Trinity软件对得到的clean reads进行组装,共获得311 822条转录本以及126 061条基因序列,最短转录本长度为301 bp,最长转录本长度为96 533 bp,平均单条转录本长度为1 420 bp,N50为2 195 bp,最短基因和最长基因均和转录本长度一样,平均单条基因为1 068 bp,基因序列在长度为200~500 bp区间数量最多,约为总数的36%(表3)。