《表3 泡桐根部基因和转录本长度分布》
提取泡桐根部RNA后由Nova-seq高通量测序,共获得366 701 960条reads序列,总碱基数为53.90 Gb,平均GC含量达44.58%。序列质量评估值Q20、Q30均达90%以上(表2),说明通过测序所得到原始序列数据较好,可用于后续的序列组装。用Trinity软件对得到的clean reads进行组装,共获得311 822条转录本以及126 061条基因序列,最短转录本长度为301 bp,最长转录本长度为96 533 bp,平均单条转录本长度为1 420 bp,N50为2 195 bp,最短基因和最长基因均和转录本长度一样,平均单条基因为1 068 bp,基因序列在长度为200~500 bp区间数量最多,约为总数的36%(表3)。
图表编号 | XD00160689200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.08.01 |
作者 | 韩良泽、陈明利、陈永华、陈昊、贾惠雁、欧阳林男 |
绘制单位 | 中南林业科技大学环境科学与工程学院、中南林业科技大学环境科学与工程学院、中南林业科技大学环境科学与工程学院、中南林业科技大学林学院、中南林业科技大学环境科学与工程学院、国家林业和草原局桉树研究开发中心 |
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