《表7 FPKM区间分布:泡桐根系应答铅锌矿胁迫的转录组分析》

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《泡桐根系应答铅锌矿胁迫的转录组分析》


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本实验采用RSEM软件[12]将Trinity拼接得到的转录组作为参考序列(ref),将每个样品的clean reads比对回ref(mapping),发现各样品均有较高的注释率(表6)。随后将RSEM对bowtie的比对结果进行统计,进一步得到了每个样品比对到每个基因上的readcount数目,并对其进行FPKM转换,结果显示,大部分样品的FPKM值位于0~0.1区间和0.3~3.57区间(表7)。