《表2 基因比对结果：南瓜干旱胁迫相关基因的转录组分析》

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《南瓜干旱胁迫相关基因的转录组分析》

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南瓜基因组组装的完成[20]为其干旱胁迫基因转录调控表达的研究奠定了基础。利用Bowtie2(v2.1.0）软件将转录组测序数据Clean Data进行基因组有参比对（表2）（参考基因组见http：//cucurbitgenomics.org/organism/8），各样品的总比对数介于22.31～26.6 Mb（比对率：38.88%～44.74%），比对到参考基因组多个位置的比对数在14.19～16.99Mb。将比对到基因组唯一位置的比对数用于后续的基因表达分析，其数量为8.06～9.67 Mb，占所有对比数的14.04%～17.74%。