《表1 碱基信息统计:PEG6000模拟干旱胁迫下银杏幼苗叶片的转录组分析》
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《PEG6000模拟干旱胁迫下银杏幼苗叶片的转录组分析》
注:s:总和;a:均值
15个c DNA文库总共产生了7.88×108个原始读数。在对这些读数进行质量控制后(表1),从原始读数中获得7.83×108个Clean reads,Q30平均碱基质量得分为95.56%,平均GC含量为45.46%,说明测序所得的c DNA文库质量较高。将得到的Clean reads运用Trinity进行从头组装,得到了总共142 271个转录本和93 750个非冗余Unigenes,转录本的长度在201~20 541 bp之间,平均长度为1 164 bp。长度大于2 000 bp的Unigenes占到13%,长度1 000~2 000 bp的Unigenes占到14%,长度小于1 000 bp的Unigenes占到73%(图1),说明此次转录组数据组装结果质量较好,可以用来进一步的分析。
图表编号 | XD00194384500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.12.28 |
作者 | 朱智博、郁万文、曹福亮、汪贵斌 |
绘制单位 | 南京林业大学南方现代林业协同创新中心、南京林业大学南方现代林业协同创新中心、南京林业大学南方现代林业协同创新中心、江苏省农业种质资源保护与利用平台、南京林业大学南方现代林业协同创新中心 |
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