《表1 香蕉根系转录组中SSR分布频率和密度》

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《香蕉根系转录组SSR位点信息分析》

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香蕉根系转录组测序共获得25158条unigene序列，序列总长为36213.776 kb，序列长度在500～12963 bp之间，平均长度为1439 bp。依照检索条件，共搜索出4663个符合条件的SSR位点，分布在3820条unigene序列上，其中，3168条unigene含单个SSR位点，占含有SSR序列条数的82.93%，其余652条unigene含有≥2个SSR位点（包含复合SSR），占含有SSR序列条数的17.07%。总体来说，含SSR的unigene序列占全部unigene序列的15.18%，SSR出现频率（检出的SSR个数/总unigene数目）为18.53%。从平均距离（香蕉转录组unigene总长度/SSR数目）来看SSR的分布情况，香蕉根系转录组中平均每7.77 kb出现1个SSR，但不同重复种类间相差极大（表1）。