《表3 三色堇转录组中SSR基序的分布》

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《三色堇转录组SSR分析及分子标记开发》


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从三色堇SSR基序的分布频率来看,三核苷酸重复基序最多,占总SSR的28.32%;在三核苷酸重复基序中又以GAA/TTC、ATC/GAT、TCA/TGA和CTC/GAG最多,分别占三核苷酸SSR的6.55%、6.34%、6.31%和6.09%,占总SSR的1.85%、1.80%、1.79%和1.72%。其次是二核苷酸重复基序,占总SSR的12.86%,其中以AG/CT和GA/TC为主,占二核苷酸SSR的31.15%和21.22%,占总SSR的4.01%和2.73%。四、五、六核苷酸重复基序出现频率均较低,分别占总SSR的1.13%、0.28%和0.06%(表3)。