《表1 水红宝巾花转录组中的SSR基序类型》

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《宝巾花基于转录组测序的SSR标记的开发和应用》

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宝巾花转录组的SSR类型丰富，包括单核苷酸至六核苷酸的所有重复类型，共包含117种重复基序，其中数量最多的3种基序为A/T、AT/AT和C/G，分别为43 222个（71.67%）、4 009个（6.65%）和1 727个（2.83%）（表1）。SSR基序的重复次数为5～25次，重复10次的SSR位点最多（10 265个，17.03%），而25次的最少（1个）（图1）。重复序列总长为10～302个碱基、平均18.1个碱基，绝大多数的重复序列总长为10～21个碱基，共（51 981个，占总数55 976个(因有2种或多种SSR基序相连，少于SSR的总数）的92.86%。