《表3 不结球白菜转录组中SSR重复类型的分布特征》

《表3 不结球白菜转录组中SSR重复类型的分布特征》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《基于不结球白菜转录组EST-SSR标记开发及多态性分析》


  1. 获取 高清版本忘记账户?点击这里登录
  1. 下载图表忘记账户?点击这里登录

在不结球白菜转录组中获得去冗余的Unigen共48 817条,其中17 009个SSR位点分布在9 001条Unigene上,发生频率为18.44%。含1个SSR位点的Unigene序列有4 082条,含2个及以上SSR位点的Unigene序列有7 875条,SSR分布频率(SSR个数与总Unigene条数之比)为34.84%。其中,单、二和三核苷酸重复为不结球白菜转录组SSR的主要类型,占SSR总量的98.31%。单核苷酸重复最多,占总量的39.70%,其次二核苷酸重复和三核苷酸重复,分别占33.06%和25.55%,然后是四、五和六核苷酸重复,分别占1.13%、0.30%和0.26%。不结球白菜SSR位点序列一至六核苷酸重复类型的平均长度分别为14.21、17.03、17.37、21.76、26.76及32.32 bp,平均长度为16.13 bp(表3)。