《表3 不结球白菜转录组中SSR重复类型的分布特征》
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《基于不结球白菜转录组EST-SSR标记开发及多态性分析》
在不结球白菜转录组中获得去冗余的Unigen共48 817条,其中17 009个SSR位点分布在9 001条Unigene上,发生频率为18.44%。含1个SSR位点的Unigene序列有4 082条,含2个及以上SSR位点的Unigene序列有7 875条,SSR分布频率(SSR个数与总Unigene条数之比)为34.84%。其中,单、二和三核苷酸重复为不结球白菜转录组SSR的主要类型,占SSR总量的98.31%。单核苷酸重复最多,占总量的39.70%,其次二核苷酸重复和三核苷酸重复,分别占33.06%和25.55%,然后是四、五和六核苷酸重复,分别占1.13%、0.30%和0.26%。不结球白菜SSR位点序列一至六核苷酸重复类型的平均长度分别为14.21、17.03、17.37、21.76、26.76及32.32 bp,平均长度为16.13 bp(表3)。
图表编号 | XD00121701600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.01.25 |
作者 | 杨丹青、何晓丽、杜志杰、王树彬、孙笠维、林义章、邵贵荣、钟凤林 |
绘制单位 | 福建农林大学园艺学院、福建农林大学园艺学院、福建农林大学园艺学院、福建农林大学园艺学院、福建农林大学园艺学院、福建农林大学园艺学院、福建金品农业科技股份有限公司、福建农林大学园艺学院、福建农林大学蔬菜研究所 |
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