《表2 青篱柴转录组SSR各重复类型的分布特征》
由表2可知,青篱柴转录组SSR位点的种类非常丰富,从单碱基到六碱基重复均有分布,对1~6 bp的SSR重复基元类型进行统计可以看出,每个重复类型所含的数量相差很大。主要重复类型是单核苷酸,占SSR总数的47.59%,其次为三核苷酸和二核苷酸,分别占27.95%、23.45%,四核苷酸、五核苷酸、六核苷酸重复的数量极少,总计占1.01%,但类型很丰富,其中四核苷酸重复基序数量高于五核苷酸、六核苷酸。从分布情况看,相应的不同重复基序长度SSR分布的平均距离差距很大,其中单核苷酸重复最多,每条SSR分布平均距离为8.36 kb,其次为三核苷酸重复,每条SSR分布的平均距离为14.23 kb,六核苷酸重复最少,每条SSR分布的平均距离为6 900.21 kb,整体上青篱柴转录组中平均每3 979 bp就含有1个SSR位点。
图表编号 | XD0035598600 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2019.01.20 |
作者 | 黄建敏、李菲、刘云静、李彦勋、汤晓辛 |
绘制单位 | 贵州师范大学生命科学学院、贵州省植物生理与发育调控重点实验室、贵州师范大学生命科学学院、贵州省植物生理与发育调控重点实验室、贵州师范大学生命科学学院、贵州师范大学生命科学学院、贵州省植物生理与发育调控重点实验室、贵州师范大学生命科学学院、贵州省植物生理与发育调控重点实验室 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |