《表1 西洋接骨木转录组不同SSR重复单元类型分布》

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《西洋接骨木转录组SSR挖掘及荧光标记开发》


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通过对西洋接骨木转录组的257 975条Unigene序列进行搜索(序列总长254 175 kb),发现其中51 336条Unigene序列中含有64 148个SSR位点,SSR位点出现频率为24.87%(SSR位点数与总的Unigene数的比值),平均每3.96 kb出现1个SSR,SSR的类型丰富,其中,单核苷酸重复是主要类型,占总SSR的51.13%。其次是二、三核苷酸重复,分别占总SSR的38.63%和9.11%。A/T和AG/CT是单核酸和二核苷酸的优势重复基元。四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复类型数量较少,分别占总数的0.86%、0.1%和0.17%(表1,图1)。