《表1 西洋接骨木转录组不同SSR重复单元类型分布》
通过对西洋接骨木转录组的257 975条Unigene序列进行搜索(序列总长254 175 kb),发现其中51 336条Unigene序列中含有64 148个SSR位点,SSR位点出现频率为24.87%(SSR位点数与总的Unigene数的比值),平均每3.96 kb出现1个SSR,SSR的类型丰富,其中,单核苷酸重复是主要类型,占总SSR的51.13%。其次是二、三核苷酸重复,分别占总SSR的38.63%和9.11%。A/T和AG/CT是单核酸和二核苷酸的优势重复基元。四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复类型数量较少,分别占总数的0.86%、0.1%和0.17%(表1,图1)。
图表编号 | XD0011746600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.12.01 |
作者 | 姚俊修、李善文、任飞、李庆华、刘学良、吴德军、燕丽萍 |
绘制单位 | 山东省林业科学研究院、山东省林木遗传改良重点实验室、山东省林业科学研究院、山东省林木遗传改良重点实验室、山东省林业科学研究院、山东省林业科学研究院、山东农业大学、山东省林业科学研究院、山东省林木遗传改良重点实验室、山东省林业科学研究院、山东省林木遗传改良重点实验室 |
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