《表3 转录组SSR各重复类型的分布特征》

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《基于转录组的黑果枸杞SSR分布特征分析及引物设计》

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分析黑果枸杞组SSR数据，其含量最多的是单碱基重复单元，占总SSR数目的74.83%，其次是二碱基重复单元和三碱基重复单元，分别占到总体微卫星序列的12.68%和11.92%，而四、五、六碱基重复类型所占比例均较低，三种重复类型的总含量不到0.6%（表3）。整体来看，不同重复类型的SSR含量以及分布具有明显的变化特征，其原因是受SSR含量的影响，随重复碱基数的增加SSR数量、所占比例、出现频率、平均距离和分布密度均呈逐渐降低的趋势，在五碱基重复类型达到最低后又稍有回升。其中，五碱基的重复单元的SSR位点数量最少，所以与其相对应的平均距离最大，为13 925.83 kb，而单碱基重复单元的平均距离仅为5.51 kb，二者间的差异高达2 527倍，说明在该转录组Unigene序列中每出现2 527个单碱基重复的SSR位点才会出现一个五碱基重复。