《表7 杭白芷转录组中SSR重复类型分布》

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《基于高通量测序技术的杭白芷(Angelica dahurica)根转录组数据分析》

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利用MISA软件对47 044条杭白芷Unigenes进行SSR特征分析（表6；表7），结果发现检测的序列总长度为54 768 810 bp，共发现10 020个SSR，占Unigenes总数的21.30%。此外，有7 792条Unigenes含1种以上的SSR位点，有907条Unigenes含复合型SSR重复单元。SSR重复类型分析显示，二碱基重复的SSR数量最多，有4 336个，占43.27%，其中AG/CT类型的比例最高；单碱基重复SSR数量次之，有3 647个，占36.40%；五碱基重复SSR最少，为37条，占0.37%。SSR重复单位数量中，重复6次的数量最多，超过2 000次，为2 067次，重复9次的最低，为480次。