《表5 转录组中SSR重复基元的类型和数量》

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《玉米野生近缘种大刍草幼苗叶片的转录组SSR分析》


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在14 099个SSR位点中共发现38种重复基元,其中,一至四核苷酸重复基元分别有2、8、15、13种。单核苷酸重复基元有A/T和C/G,其中,A/T出现频率最高,占总SSR的21.06%;在二核苷酸重复基元中,AG/CT出现次数最多,占二核苷酸重复的25.90%,占总SSR的6.76%;三核苷酸重复基元种类最多,以CCG/CGG出现次数最多,占三核苷酸重复的30.99%,占总SSR的5.53%,其次为AGC/CTG、CAG/CTG和CTC/GAG,分别占总SSR的2.35%、2.35%和2.25%,这4种重复类型共占总SSR的12.47%。四核苷酸重复基元数量较少,仅占总SSR数量的0.37%(表5)。