《表3 SSR中重复基元类型及数量》

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《基于天竺桂转录组测序的SSR序列分析及EST-SSR标记开发》

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各种SSR重复类型差异较大，其中单核苷酸重复数量所占比例最高5 494 （52.39%），其次是二核苷酸2 560 （32.83%），三核苷酸占1 696 （20.94%），四核苷酸、五核苷酸、六核苷酸类型占总核苷酸类型的比例较少，分别占84 （0.079%）、14 （0.013%）和11（0.010%），此外还有部分复合碱基，占总数的653（6.19%）。进一步对天竺桂SSR特征进行分析，在单核苷酸重复中，A/T占单核苷酸总数的99.50%（表3）。在二核苷酸重复中，AG/TC占比最高40.9%，其次CT/GA占37.7%。三核苷酸重复中AAG/CTT占26.2%（444），AGA/TCT占13.5%（229）。四核苷酸84个，AAAT/TTTA频率最高10.7%（9）。各个类型的五核苷酸（14）、六核苷酸（11）各重复基元皆不相同（表3）。