《表6 不同重复基元类型SSR的重复碱基组成数据库部分结果Tab.6 Part of the repeated base coposition database》
在一串红基因组数据库中从总长为438 155 920bp的序列中共查找出95 982个SSR位点,平均4 565bp出现1个SSR。单碱基重复单元的SSR含量最多,占总数的41.6%,其次为二碱基重复(25.9%),复合型(13.8%),三碱基重复(13.6%),六碱基重复(1.9%),五碱基重复(1.6%)和四碱基重复(1.6%)(表5) 。每种碱基重复单元包含不同种类的重复碱基,其中单碱基重复SSR由4种不同的重复碱基组成,二碱基、三碱基、四碱基、五碱基、六碱基核苷酸重复SSR组成类型分别为12种、63种、149种、470种、993种,不同重复基元类型SSR的重复碱基组成数据库部分结果见表6。
图表编号 | XD004178400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.04.01 |
作者 | 王硕、葛秀秀、孔维一、陈洪伟、刘克锋、王红利 |
绘制单位 | 北京农学院生物科学与工程学院、北京农学院生物科学与工程学院、北京农学院农业部华北都市农业重点实验室、北京农学院植物科学技术学院、北京农学院城乡发展学院、北京农学院城乡发展学院、北京农学院园林学院 |
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