《表4 SSR不同重复基序分布及优势碱基组成》

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《基于PacBio平台的紫娟茶树全长转录组分析》

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采用MISA对紫娟全长转录组Gene进行SSR位点检测，搜索标准为：1～6个核苷酸基重复次数分别为大于等于10、6、5、5、5和5；有180 293个序列检测到SSR位点单苷酸和二核苷酸重复类型占优势，分别占总SSR的57.43%和23.98%；其次是三核苷酸占17.13%，其他3种重复类型所占比例相对较少：四核苷酸重复占0.57%；五核苷酸重复占0.26%；六核苷酸重复占0.62%。在检测到的SSR位点中单核苷酸中出现频率最高的核苷酸基序为T/A（42 818）；二核苷酸以CT/GA最多有10 705个，其次是TC/AG和AG/TC分别有10 039个和6 374个；三核苷酸以CAG/GTC（5 791）、CTA/GAT（4 460）和ACA/TGT（4 470）占优势；四核苷酸出现频率以TTTA/AAAT（148）和TTAT/AATA（54）为多；五核苷酸和六核苷酸分别以TGTGT/ACACA（74）和GCCACC/CGGT GG（127）居多（表4）。