《表1 沟渠豹蛛SSR不同碱基重复类型,数量与分布》

《表1 沟渠豹蛛SSR不同碱基重复类型,数量与分布》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《基于转录组的沟渠豹蛛SSR信息分析》


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采用MISA对沟渠豹蛛转录组数据中13 366个大于1kb的Unigene进行SSR检测。结果显示,7778个序列中共含有SSR标记10 708个,其中,含有1个以上SSR标记的序列有2 487个。SSR发生频率(含SSR的Unigene数目与总Unigene数目之比)为58.19%,SSR出现频率(检出SSR个数与总Unigene数目之比)为80.11%。在沟渠豹蛛转录组中,SSR位点的序列总长度为129 851 bp,平均每隔12.13 bp就有一个SSR位点出现,SSR位点的平均长度从单碱基到六碱基重复分别为11.27 bp、13.58 bp、16.25 bp、20.25 bp、26.25 bp和54.00 bp (表1)。