《表2 黄麻与不同物种间SSR重复类型的频率分布比较》

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《黄麻全基因组SSR鉴定与特征分析》

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如表2所示，重复基元的重复次数对于不同重复基元种类而言是不同的，如三核苷酸重复基元的重复次数在基因组和cDNA中分别是二核苷酸的0.9倍和5.4倍，分别是四核苷酸的0.9倍和3.5倍，体现出三核苷酸重复基元在cDNA中较频繁地发生。对比黄麻SSR重复基元在全基因组和cDNA中的分布频率，可以发现，SSR在基因组中，二、三核苷酸的平均重复序列长度比其他种类要长，显示出二、三核苷酸重复在黄麻基因组SSR中较频繁地发生，且其重复基元数量在基因组SSR中比例也最多。统计黄麻SSR，黄麻最长的平均重复序列长度为三核苷酸重复基元。其中，重复基元AAT重复次数达2511，重复序列长度达到7533 bp；其次重复基元AAG，重复次数达2246。Karaoglu等[17]研究显示，较长的重复序列长度通常倾向于具有较高的突变率，这与SSR的多态性息息相关。