《表2 中国南瓜EST-SSR的类型、数量与分布频率》

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《中国南瓜转录组SSR信息分析及其分子标记开发》

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中国南瓜转录组SSR种类较为丰富，各种重复类型的出现频率有较大差异，SSR重复类型6种均有，即单核苷酸至六核苷酸重复，另外还有复合SSR类型，其中单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸重复出现频率占优势，分别占总SSR的47.92%、24.45%和19.66%；四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复类型数量较少，分别占总数的1.39%、0.26%和0.26%，复合SSR占总数的6.07%。从重复次数看，中国南瓜转录组SSR重复基序的重复次数分布在5～26次之间，其中5～10次的SSR共有3 445个，占总数的63.71%；其次为11～20次的SSR，共有1 867个，占总数的34.53%；20次重复以上的仅有95个，仅占1.76%（表2）。