《表2 重楼SSR的类型,数量及分布频率》

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《高通量RNA-seq技术开发梵净山重楼SSR标记》

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在重楼块根转录组的38 802条Unigene中，利用MISA程序共搜索挖掘出6 333个SSR标记，这些标记分布在5 666条Unigene中，含有SSR位点的Unigene数量占总Unigene数量的比值为14.60%。对于发现SSR位点的5 666条Unigene，其中每条至少含有1个SSR位点，且492条含有两个或两个以上的SSR位点，平均每4 700 bp含有1个SSR位点（表1）。梵净山重楼的优势重复基序是二核苷酸（占总SSR位点的66.76%）、其次是三核苷酸（18.77%）和单核苷酸（11.50%），四核苷酸重复占0.25%，五核苷酸重复占0.54%，六核苷酸重复占2.18%（表2）。单核苷酸的优势重复基元是A/T、AG/CT和GA/TC是二核苷酸的优势重复基元，CAG/CTG和CCG/CGG是三核苷酸的优势重复基元。