《表2 弓背青鳉肝脏转录组SSR类型及数量》

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《雌、雄弓背青鳉(Oryzias curvinotus)肝脏转录组比较分析》

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利用MISA软件对弓背青鳉进行SSR标记鉴定，用于遗传多样性研究。有18326条unigenes序列含有SSR标记，共计28195个，其中6373条unigenes包含一个以上的SSR。各种类型的SSR标记出现的频率不同（表2），单核苷酸重复SSR出现的频率最高，占总SSR的73.17%，其次是三核苷酸重复SSR，占总SSR的19%。另外，不同重复序列的相对丰度差异很大。A/T在单核苷酸SSR中最常见，在双核苷酸SSR中，AG/CT最为常见。AGG/CCT和AAAC/GTTT是三、四核苷酸SSR中最常见的元件。