《表2 红螯螯虾转录组SSR基序类型分布》

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《红螯螯虾转录组中的SSR位点信息分析》

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从红螯螯虾转录组SSR核苷酸基序类型来看，其中11 054个SSR位点包含68种重复基元，二核苷酸至六核苷酸重复基元分别有4、10、26、11、17种；从分布频率来看，出现最多的重复基元是AC/GT(3 324个，占30.07%）和AAT/ATT(1 371个，占10.56%）。二核苷酸重复基元以AC/GT、AG/CT和AT/AT为主，占其总数的99.67%。三核苷酸重复基元以AAT/ATT、AGC/CTG和ACC/GGT最多，分别占其总数的28.03%、23.86%和12.41%。四核苷酸重复基元以ACAT/ATGT、AAAT/ATTT和ACAG/CTGT最多，分别占其总数的28.62%、15.86%和15.86%；五核苷酸重复基元以AACCT/AGGTT和AAGAT/ATCTT出现频率最高，分别占其总数的20%和12%；六核苷酸重复基元以ACCTGG/AG-GTCC和ACGCCC/CGTGGG出现频率最高，分别占其总数的15.38%和11.54%（表2）。