《表1 红螯螯虾转录组测序EST-SSR搜索》

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《红螯螯虾转录组中的SSR位点信息分析》

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通过对红螯螯虾转录组的67 369条Unigene（序列总长约68 775.32 kb）序列进行搜索，发现这些Unigene序列中含有22 727个SSR位点，其中4 211条Unigene含有2个或2个以上EST-SSR位点。总体上，SSR发生频率为33.74%，平均每3.03 kb出现1个SSR。红螯螯虾转录组SSR的类型较为丰富，二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸及六核苷酸重复类型均存在。其中二核苷酸和三核苷酸重复类型出现频率较多，分别占总SSR出现频率的52.67%和44.25%；四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复类型出现频率较少，分别占总SSR出现频率的2.62%、0.23%和0.24%（表1）。