《表2 红螯螯虾转录组拼接结果统计》
由表1可知,通过Illuminate Hiseq 2000高通量测序共获得了147 915 744条高质量短读序片段,总长度为21 891 279 947 bp,Q 20值为98.30%,GC含量占比为40.75%。由Trinity软件组装,共组装67 369个Unigene,总长度为69 887 464 bp,平均长度为1 218 bp,N50长度为1 376 bp。对Unigene的长度分布特征进行分析可知(图1),在总Unigene中,0~400 bp区段所含的Unigene比例为12.6%,共8 489个;400~600 bp区段的Unigene比例最高为32.38%;601~800 bp区段的Unigene占16.26%。经拼接后,共有Unigenes 67 369个,总长度69 887 464 bp;总isoform数为93 411个,从长度为12 690 867.4 bp,平均长度1 037.38bp,最大isoform长度为34 002 bp(见表2~3,图2)。
图表编号 | XD0056479800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.04.28 |
作者 | 李喜莲、郭建林、黄振远、慎佩晶、施伟达、顾志敏 |
绘制单位 | 农业部淡水渔业健康养殖重点实验室、浙江省淡水水产遗传育种重点实验室、浙江省淡水水产研究所、农业部淡水渔业健康养殖重点实验室、浙江省淡水水产遗传育种重点实验室、浙江省淡水水产研究所、农业部淡水渔业健康养殖重点实验室、浙江省淡水水产遗传育种重点实验室、浙江省淡水水产研究所、农业部淡水渔业健康养殖重点实验室、浙江省淡水水产遗传育种重点实验室、浙江省淡水水产研究所、农业部淡水渔业健康养殖重点实验室、浙江省淡水水产遗传育种重点实验室、浙江省淡水水产研究所、农业部淡水渔业健康养殖重点实验室、浙江省淡水水产遗传育种重点 |
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