《表2 槜李转录组SSR基序类型分布》

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《基于转录组测序的槜李EST-SSR标记开发》


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槜李花转录组SSR的基序类型出现最多的基元是AG/CT(4 914个,占45.54%),其次是A/T(2 239个,占20.75%)(表2)。单核苷酸至四核苷酸重复基元的主要重复基元及占比分别为:A/T(99.03%)、AG/CT(85.95%)、AAG/CTT(31.24%)、AGC/CTG(15.60%)、ATC/ATG(12.78%)、AAAT/ATTT(22.60%)、AAAG/CTTT(14.38%)。各类五核苷酸及六核苷酸重复出现频率均较低,槜李转录组SSR基序类型及频率特征与西红花转录组类似(李军等,2017)。