《表3 转录组中SSR分布类型》
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《基于RNA-seq东北林蛙(Rana dybowskii)微卫星特征分析及应用》
为了解东北林蛙转录组SSR分布类型,对不同重复单元类型的丰度及重复次数进行了分析。由表3可见,不同长度核苷酸的重复序列中重复序列长度与微卫星的数量呈负相关,核苷酸重复序列越长,东北林蛙转录组序列中核苷酸重复序列的出现频率越低。东北林蛙转录组微卫星重复次数变化差异较大。二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸、六核苷酸在重复次数分别超过49,24,17,11,14时丰度几乎降为0,在重复次数为12时,二核苷酸丰度降低明显。
图表编号 | XD00162460300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.01 |
作者 | 迟天舒、周政霖、张秀惠、杨宝田、董丙君、周瑜 |
绘制单位 | 沈阳师范大学生命科学学院、沈阳师范大学生命科学学院、沈阳师范大学生命科学学院、沈阳师范大学生命科学学院、沈阳师范大学生命科学学院、沈阳师范大学生命科学学院 |
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