《表3 韭菜全长转录组中SSR基序的分布》

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《韭菜全长转录组SSR信息分析及分子标记开发》

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从表3可知，二核苷酸重复基序中AC/GT(333个），CA/TG(300个），TA/TA(296个）的出现频率较高，分别占二核苷酸重复总数的20.28%、18.27%和18.02%。三核苷酸中出现最多的重复基序是GAA/TTC(242个），占三核苷酸总数的9.38%，其次是AAG/CTT(210个）、ATC/GAT(161个）、AAT/ATT(155个）、CAG/CTG(155个）和TCA/TGA(150个），分别占三核苷酸总数的8.14%、6.24%、6.01%、6.01%和5.82%，最少的是GTA/TAC(7个），只占三核苷酸总数的0.27%。四核苷酸中出现最多的重复基序是TGTA/TACA(13个）和AAAT/ATTT(13个），各占四核苷酸总数的11.82%。五核苷酸中以AAAAG/CTTTT(2个）、TTTTC/GAAAA(2个）和AGAAA/TTTCT(2个）出现频率最高，各占五核苷酸总数的14.29%。六核苷酸中出现频率最高的是TTCAAA/TTTGAA(5个），占六核苷酸总数的12.5%，其次是GATTCG/CGAATC(2个）和GGAGCA/TGCTCC(2个），各占六核苷酸总数的7.5%。