《表2 韭菜SSR的类型、数量及分布频率》

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《韭菜全长转录组SSR信息分析及分子标记开发》


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在搜索到的韭菜转录组SSR中,单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸重复类型出现的频率占优势,分别占总SSR的66.55%、12.52%、19.67%;四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸的重复类型出现的频率很低,只占总SSR的1.26%(表2)。韭菜转录组SSR重复单元的重复次数分布在5~289次之间,其中5~10次重复的SSR位点有7 667个,占总数的58.48%;11~20次重复的SSR位点有4 220个,占总数的32.19%;20次重复以上的SSR位点有1 224个,占总数的9.34%(表2)。韭菜转录组SSR的长度主要集中在10~289 bp,其中长度在10~15 bp的SSR有9 586个,占总数的73.11%,长度在16~20 bp的SSR有1 542个,占总数的11.76%,长度在21~25 bp的SSR有681个,占总数的5.19%,长度大于25 bp的SSR有1 302个,占总数的9.93%。