《表2 藤茶转录组SSR的类型,数量及分布频率》

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《藤茶转录组SSR分子标记开发与初步验证》


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藤茶转录组SSR类型多样,6种重复类型(单核苷酸至六核苷酸)均可以找到,但出现的频率不同(表2),其中单核苷酸重复所含的SSR位点数量最多(22 755个),占SSR位点总数的比例为66.11%;其次为二核苷酸和三核苷酸重复类型,SSR数量分别为6 866和4 310个,分别占总SSR的19.95%和12.52%;四、五、六核苷酸重复类型数量很少,总共仅占1.42%。藤茶SSR重复基序的重复次数在5~24次之间,其中重复次数在5~11次之间的SSR位点有21 515个,占总个数的63.54%;11次重复以上的有12 551个,占36.46%。其中二核苷酸和六核苷酸均以重复6次最多,三、四、五核苷酸均以重复5次最多(表2)。