《表1 藤茶转录组中SSR分析》

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《藤茶转录组SSR分子标记开发与初步验证》

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经组装后共获得92 472条Unigene序列，采用MISA软件对藤茶转录组的92 472条Unigene序列（总长度为111 686 708 bp）进行SSR位点鉴别和搜索，共检测到34 420个SSR位点，出现频率为37.22%；有27 096条Unigene包含SSR位点，其中有5 820条序列含有至少两个SSR位点，2 064条序列含有复合型SSR位点，分布频率（含SSR位点的Unigene数/总Unigene数）为21.48%（表1）。从分布情况可以计算出，平均分布距离为31.69 kb，即藤茶转录组中平均31.69 kb有1个SSR。