《表1 楸树转录组中SSR特征分析》

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《楸树EST-SSR标记开发及种质资源的遗传多样性分析》

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利用MISA软件分析Unigene长度为>1 kb的14 634条序列，发现3 269（22.3%）条序列中含有3 999个SSR位点（484个复合位点），580条序列包含2个及以上位点。楸树转录组中平均每7.51 kb含有一个SSR位点。在鉴定的SSR位点中，单核、二核、三核、四核和五核苷酸重复分别具有2种（1 957）、4种（1 164）、10种（834）、14种（41）、2种（3）种类型（表1）。有趣的是本研究中未检测到六核苷酸重复的SSR位点。单核苷酸重复（1 957，48.94%）是最常见的SSR类型，其次是二核苷酸重复（1 164，29.11%），三核苷酸重复（834，20.86%），四核苷酸重复（41，1.03%）和五核苷酸重复（3，0.08%）（表1）。