《表1 星天牛转录组SSR重复基元类型及优势重复基元的组成数量》

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《星天牛转录组SSR位点特征分析》

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在星天牛转录组SSR的所有核苷酸重复类型中，单核苷酸（p1）重复基元的SSR占比最高（79.03%）。其次是三核苷酸（p3）重复，占12.54%（表1）。在已获得的82种重复基元中，三核苷酸类型最多（52种），其次是四核苷酸（p4)15种、二核苷酸（p2)11种、单核苷酸4种。其中，在三核苷酸重复的52个基元类别中，SSR位点数范围在1-18之间，最多的是TTA，其次是TAA(17）、GAA(17）、ATA(16）、AAG(16）、ATT(15）；在其基元类型中AAT/ATT的SSR位点数目是91个，占总SSR位点的3.86%，高于其他三核苷酸重复基元类型，AAG/CTT、AGC/CTG依次占比为2.84%、1.53%，其他三核苷酸基元类型占比不足1%（图1）。在核苷酸重复类型中，A/T重复基元类别最丰富，所占比例高达99.30%；AT/AT、AAT/ATT、AAAT/ATTT分别在二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸中出现频率最多，它们在其各自重复基元类型中分别占比70.79%、30.74%、57.14%。表明在星天牛转录组SSR位点中富含A、T碱基。