《表2 怒江红山茶转录组SSR各重复基元及其比例》

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《基于高通量测序的怒江红山茶微卫星位点特征分析》


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不同核苷酸重复类型的重复基元所占的比例差异较大。其中单核苷酸的重复类型中以A/T基元居多,占10.92%,而C/G较少,仅占总数的2.56%。二核苷酸重复类型中各基元所占比例差距较大,其中AG/CT基元所占比例最大,达到49.72%,基本占了一半;AT/AT基元和AC/GT基元所占比例相差不多,分别为5.12%和4.59%;CG/CG基元所占比例最少,为0.07%,其基元所占比例顺序依次为AG/CT>AT/AT>AC/GT>CG/CG;三核苷酸重复类型中AAG/CTT基元所占比例较多,为5.56%,其次是ACC/GGT基元,ATC/ATG基元和AGG/CCT基元,所占比例分别为3.66%,3.00%和2.47%,AAC/GTT基元,AAT/ATT基元和AGC/CTG基元所占比例相差不大,分别为1.95%,1.23%和1.15%,而以CCG/GGC基元,ACT/AGT基元和ACG/CGT基元所占比例较低,都小于1%(表2,图2)。四、五、六核苷酸中各重复基元出现的频率均较低,所以未对其进行分析。